Naatriumkloriit on ohtlik keemiline aine. See on stabiilne toatemperatuuril ja tavalistes ladustamistingimustes. See peaks olema happest kaugel, kuna see on väga lihtne reageerida happega ja vabastada kloordioksiidigaasi. Naatriumkloriit ei tohiks olla tugev krahh ega kontakt redutseeritava materjali ja happega, vastasel juhul võib see olla plahvatus või tulekahju.
